Самое распространенное осложнение у гриппа — это, конечно, пневмония. Она может иметь как первичную гриппозную вирусную, так и вторичную бактериальную либо смешанную вирусную, а также бактериальную этиологию. Так, первичная гриппозно-вирусная пневмония встречается довольно редко, однако протекает тяжелее прочих легочных осложнений.Такая болезнь начинается в виде острого гриппа, симптомы коего не утихают, а, наоборот, неумолимо прогрессируют, сопровождаясь при этом стойкой лихорадкой, а также одышкой и цианозом. При этом мокроты мало, однако она может содержать даже кровь. На первых стадиях такого заболевания физикальные симптомы малочисленны. В запущенных случаях появляются и диффузные хрипы, а на рентгенограмме легких видны признаки диффузной и интерстициальной инфильтрации либо острого респираторного т.н. дистресс-синдрома. В подобных случаях отмечается, кроме того, значительная артериальная гипоксия. 
Вторичная же бактериальная пневмония являет собой осложнение, при коем бактериальная инфекция развивается уже после видимого выздоровления больного. Причем через два-три дня после ухода признаков острого гриппа общее состояние больного улучшается, но после вновь появляется лихорадка, которая сопровождается клиническими симптомами, характерными для бактериальной пневмонии — кашлем, а также образованием гнойной мокроты, плюс, физикальными или рентгенологическими признаками т.н. слипчивого процесса, протекающего в легких. Такие пневмонии хорошо поддаются лечению антибиотиками, особенно если оно начато своевременно.
Но наиболее часто из существующих пневмонических осложнений, которые возникают в ходе вспышки гриппа, встречается именно смешанная вирусная, а также бактериальная пневмония, которая характеризуется чертами не только первичной, но и вторичной пневмоний, что описано было выше. Причем острое заболевание стойко, но постепенно прогрессирует, однако может произойти даже временное улучшение общего состояния больного, после чего вновь происходит его сильное ухудшение, а потом клиническое проявление обычной бактериальной пневмонии. 
За исключением легочных осложнений у гриппа может развиться и большой ряд внелегочных осложнений. 
Так, серьезным осложнением гриппа типа В, а в гораздо меньшей степени гриппа типа А, плюс, ветряной оспы или опоясывающего герпеса признается синдром Рейе. Он появляется, обычно, у детей, находящихся в возрасте от двух до шестнадцати лет, уже через несколько дней по окончании обычного, абсолютно ничем не примечательного протекания вирусного заболевания. Данный синдром Рейе характеризуется возникновением тошноты, а также рвоты в течение одного-двух дней, после чего появляются изменения, протекающие со стороны ЦНС — нарушения ментального статуса, которые варьируются от сонливости и до комы, а порой делирии и судороги
Существуют сообщения о единичных случаях миозита, рабдомиолиза, а также миоглобинурии, которые осложняют течение гриппозной инфекции. Конечно, миалгии довольно распространены при гриппе, но настоящий миозит встречается очень редко. При остром миозите очень высока чувствительность у пораженных мышц, наиболее часто мышц нижних конечностей. Больные испытывают невыносимую боль и при легком прикосновении, например, постельного белья. В самых тяжелых случаях наблюдаются как отек, так и дряблость мышц. 
Кроме того, возможные поражения ЦНС характеризуются энцефалитом, поперечным миелитом, а также синдромом Гийена—Барре. Однако этиологическая связь у вируса гриппа с данными расстройствами не установлена.
За исключением осложнений, затрагивающих отдельные специфические системы органов, которые описаны выше, всякая вспышка гриппа выбирает отдельные группы лиц повышенного риска.